Software


佐藤直樹制作ソフトウェア

English

SISEQ
A simple sequence manipulation tool
遺伝子データベースや複数配列ファイルの取り扱いのためのプログラム。
(Mac, Windows, UNIXに対応)
ここをクリックして下さい.


prsrch
A simple tool for primer design
Click here to download source code.
To compile this software, you need SISEQ.
Edit the makefile for the path to SISEQ source.

 
 


GenoMap
A tool for graphical representation of microarray data
遺伝子データベースや複数配列ファイルの取り扱いのためのプログラム。
(MacOS Xを含むUNIXに対応)
ここをクリックして下さい.


Gclust
A software for genome-wide clustering
(MacOS Xを含むUNIXに対応)
ここをクリックして下さい.


ハイパーカードスタック

ハイパーカードというのは、マックのソフトで、昔のPerformaにはついていましたが、OS Xの時代になり,Classicで細々と働き続けています。当研究室では,いまでも68KのPowerBookたちがProtocolを載せて活躍しています。


NStimer : 研究室で使うタイマー。

Buffers and Media : 研究室で使う培地や緩衝液の組成と計算ができるもの。

HyperNotebook : 整理しやすくした実験ノート。日付と項目によるインデックスから関連項目をサーチできる。

Protocols (Mac binary) : 研究室で行う実験のやり方をまとめたプロトコール集。

リンクでつながっており,また,溶液の組成の計算,実験結果の計算などのページにジャンプする。タイマーも組み込まれている。硫安沈殿の計算は便利。


Protocol_t : 上記のプロトコール集のテンプレート版。研究室の実験にあわせて編集できる。

HyperChloroplast : 葉緑体関連のプロトコール集(学生実習の参考になる)。

nkf_mac : 漢字コード変換ソフト。

もともとunixで使われているnkfをマックでも使えるようにコンパイルしたものです。漢字コードは、マックやウィンドウズでは shift-jis (sjis)ですが、UNIXではたいてい euc ですので、ダウンロードしたテキストが文字化けして困ることがあると思います。そういうときに、これを使ってsjisにするとちゃんと読むことができます。なお、同じような場合に、改行コードも違っているためにきちんと表示されないことがあります。この場合には、上記のsiseqの中のtxtrコマンドを利用して下さい。


Last update: April 12, 2007.

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